La Edad Media estuvo presidida por la dominación de varias familias nobiliarias, dentro del marco de las guerras de bandos que asolaron el País Vasco entre los siglos XIV y XV.
En el seno de los grupos de la nobleza jarrillera destacaron los Salazar los cuales erigieron la casa-torre que lleva su nombre. Entre ellos destacar a Lope García de Salazar, famoso banderizo y cronista que fue Preboste de la Villa.
Desde el punto de vista monumental es importante la actual Basílica de Santa María, la cual parece ser que se empezó a edificar en 1492.
Cuadro cronológico:
- 1432 – Confirmación Don Juan I.
- 1459 – Fecha de las más antiguas Ordenanzas Municipales de la Villa 1468 Se reproduce el fuego guerrero pero esta vez en el Duranguesado, elorrianos y durangueses se habían levantado en armas. En la contienda murieron cuatro Salazares, vistiéndose de luto toda la Villa de Portugalete.
- 1476 – Fernando de Aragón visita a Portugalete.
- 1483 – Confirmación de Isabel La Católica El 4 de septiembre llegó la Reina Doña Isabel la Católica, ataviada con un traje de estilo vizcaína. Quiso la reina con su presencia invitar a la paz y concordia a los bandos y linajes que mantenían rivalidades desde mucho tiempo atrás, aparte de confirmar el Fuero Portugalujo el 8 de septiembre de 1483.
- 1492 – Se halla ya comenzada la construcción de la Basílica de Santa María.